A spatial mRNA profiling workflow using Rapid Amplified Multiplex FISH (RAMFISH)
이 논문은 반복적인 하이브리드화와 완전 자동화된 분석 파이프라인을 통해 온전한 조직 내 30개 이상의 mRNA에 대한 견고하고 반정량적인 공간적 프로파일링을 가능하게 하는, 접근 가능하고 오픈 소스이며 모듈화된 워크플로인 RAMFISH를 소개한다.
243 편의 논문
분자생물학은 생명 현상의 가장 기초적인 단위인 분자 수준에서 일어나는 복잡한 과정을 탐구하는 분야입니다. 유전 정보가 어떻게 저장되고 복제되며, 이 정보가 어떻게 세포를 구성하는 단백질로 변환되어 우리 몸의 기능을 조절하는지 그 비밀을 밝히는 것이 핵심입니다.
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아래에는 분자생물학 분야에서 최근 게재된 최신 논문 목록이 정리되어 있습니다.
이 논문은 반복적인 하이브리드화와 완전 자동화된 분석 파이프라인을 통해 온전한 조직 내 30개 이상의 mRNA에 대한 견고하고 반정량적인 공간적 프로파일링을 가능하게 하는, 접근 가능하고 오픈 소스이며 모듈화된 워크플로인 RAMFISH를 소개한다.
단기적인 식이 메티오닌 결핍은 주요 대사 및 신호 전달 유전자의 데 노보(de novo) 일주기 진동을 유도함으로써 간의 m6A RNA 메틸화 역학을 재프로그래밍하며, 이를 통해 m6A 변형이 메티오닌 대사와 일주기 조절 및 항상성을 연결하는 핵심 기제임을 확립한다.
이 연구는 초저온 전자 현미경을 활용하여 apo-PIWIL4-HSP90 복합체의 구조를 밝혀냈으며, HSP90이 PIWI 링커 도메인에 결합하여 이를 펼침으로써 독특한 열린 구조를 안정화한다는 것을 입증하였는데, 이는 PIWI 단백질 전반에 걸쳐 보존된 메커니즘이자 piRNA 생성에 필수적인 기전이다.
이 연구는 나무개구리 간에서 일어나는 역동적인 히스톤 라이신 메틸화 및 탈메틸화가 전사 조절을 위한 핵심적인 후성유전학적 기제로 작용하며, 이를 통해 유전자 발현을 조절함으로써 개구리가 장기간의 무산소 상태와 결빙 상태에서 저대사 상태를 유지하고 스트레스에 적응하여 생존할 수 있도록 한다는 것을 입증한다.
이 연구는 라파마이신으로 자가포식을 약리학적으로 유도하는 것이 급성 전신 조사 후 생쥐의 장 재생을 가속화하고 생존율을 향상시키는 반면, 클로로퀸으로 자가포식을 억제하는 것은 방사선으로 인한 위장관 손상을 악화시킨다는 것을 입증한다.
본 연구는 종 특이성이 없는 질량 분석법을 사용하여 생쥐의 노화에 따른 혈장 세포외 소포체 단백질체 특성을 규명함으로써, 노화와 연관된 단백질 시그니처, 성별 차이, 그리고 노화와 건강 수명을 모니터링하기 위한 매우 정확한 단백질 시계 구축을 가능하게 하는 새로운 바이오마커를 밝혀냈다.
FlexRibbon은 마스크 언어 모델링과 확산 기반 디노이징의 결합을 사용하여 아미노산 서열과 3차원 구조를 공동으로 사전 학습함으로써, 다중 서열 정렬(MSA)에 의존하지 않고도 기존의 MSA 기반 방식들이 어려움을 겪는 변이가 풍부한 영역을 중심으로 다양한 작업에서 최첨단 성능을 달성하는 새로운 단백질 파운데이션 모델입니다.
본 연구는 항생제 내성 플라스데이드에 풍부하게 존재하며 파지의 복제를 감지하여 NAD 고갈과 절멸적 감염을 유발함으로써 작동하는, 표현형 유도 조사(phenotype-guided interrogation)를 통해 발견된 새로운 가동성 방어 기제인 DUF4062 기반의 광범위한 에반게리온(Evangelion) 패밀리를 식별한다.
본 연구는 특정 방어 체계나 파지 꼬리 유전자가 아닌 박테리아 균주의 정체성이 낭성 섬유증 관련 *Achromobacter*에서 파지의 감염성을 결정하는 주요 동인임을 입증하며, 이는 합리적인 치료 설계의 지침을 마련하기 위해 개별 파지-숙주 쌍에 대한 정량적 표현형 분석이 필수적임을 강조한다.
본 연구는 불확실한 변이의 분류를 해결하고, 환경 의존적 병원성을 밝히며, 유전성 코프로포르피린증을 이해하기 위한 포괄적인 자원을 제공하기 위해 정상 및 수은 노출 조건 모두에서 발생 가능한 거의 모든 CPOX 아미노산 치환의 기능적 영향을 체계적으로 매핑한다.